速攻で自己レス。

uridev - IEでDOM（setAttribute問題）

上記記事で書いてた問題については、
prototype.jsで十分に対応できるものでした。
（詳細は後日、、、書かないかも・・・）

これまで如何に無駄な使い方しかしてなかった事に改めて気付きました。
（「$()」くらいしか使ってないような・・・汗）
せっかく便利なもの使ってるんだから、もっと活用せねば。

今回のような体験した後で仕様とか眺めてみたら、
理解が早かったです。やっぱり、手を動かすのは大切ですね。